XCOM ist die Neuauflage der klassischen Geschichte vom Kampf der Menschheit gegen einen unbekannten Feind, bei der die Spieler direkt in die Schuhe eines FBI-Agenten schlüpfen, der die wachsende Bedrohung analysieren und bezwingen soll. Sie müssen wie bei den Wurzeln der Serie üblich trotz aussichtsloser Ausgangssituation mit riskanten strategischen Manövern und nervenaufreibenden Kampfeinsätzen den menschlichen Einfallsreichtum – und die menschlichen Schwächen – gegen einen Feind jenseits jeder Vorstellungskraft unter Beweis stellen. Durch den Wechsel in die Egoperspektive spüren die Spieler nun wie niemals zuvor die Spannung und Furcht im Kampf gegen einen unbekannten Feind, der seine Fühler immer weiter und brutaler in unsere Welt ausstreckt.